Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms