Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX5Q9H2C1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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