Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms