Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM2Q9BVW6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms