Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3CQ9BUI4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3CQ9BUI4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms