Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF559Q9BR84 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms