Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms