Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms