Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL2Q99962 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3GL2Q99962 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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