Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms