Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAD9AQ99638 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms