Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms