Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYCBPQ99417 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms