Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP5Q96PP8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP5Q96PP8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms