Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms