Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKD1Q969G9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKD1Q969G9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms