Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms