Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms