Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PYDC1Q8WXC3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PYDC1Q8WXC3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PYDC1Q8WXC3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PYDC1Q8WXC3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PYDC1Q8WXC3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms