Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO7Q8WWI1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms