Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGBL3Q8NEM8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL3Q8NEM8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms