Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms