Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC9CQ8N5M4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC9CQ8N5M4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC9CQ8N5M4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9CQ8N5M4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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