Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8AQ8IWT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8AQ8IWT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms