Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX7Q7RTT5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms