Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms