Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms