Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SFTA2Q6UW10 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SFTA2Q6UW10 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SFTA2Q6UW10 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SFTA2Q6UW10 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SFTA2Q6UW10 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms