Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSSK4Q6SA08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms