Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms