Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC183Q5T5S1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms