Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms