Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF628Q5EBL2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms