Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM41BQ5BJD5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM41BQ5BJD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms