Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GLE1Q53GS7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GLE1Q53GS7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms