Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms