Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms