Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms