Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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