Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TLR1Q15399 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TLR1Q15399 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TLR1Q15399 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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