Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN1Q15223 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
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