Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC1Q13547 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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