Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms