Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIGQ13278 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIGQ13278 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIGQ13278 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIGQ13278 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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