Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms