Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.074e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-222ENST00000477470 680 ntTSL 38.12□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-223ENST00000488784 863 ntTSL 58.02□□□□□ -1.134e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 SLC38A6-209ENST00000526539 755 ntTSL 46.81□□□□□ -1.324e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-224ENST00000493625 958 ntTSL 54.52□□□□□ -1.694e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 513.24□□□□□ -0.294e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 512.28□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 519.08■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-9■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 SYNGAP1-224ENST00000637721 190 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-9■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.76□□□□□ -0.538e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 TRIM25-205ENST00000572021 1555 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.542e-9■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 SYNGAP1-201ENST00000293748 4556 ntTSL 511.48□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 TRIM25-208ENST00000574234 471 ntTSL 25.54□□□□□ -1.522e-9■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 SYNGAP1-218ENST00000636905 123 ntTSL 55.16□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 NCOA2-205ENST00000520416 526 ntTSL 320.54■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 316.89■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AKR1A1-212ENST00000496999 775 ntTSL 216.74■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AKR1A1-209ENST00000481885 516 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.86□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 56.66□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 519.16■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 CLDN12-213ENST00000496677 1098 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 CLDN12-204ENST00000416322 1163 ntTSL 59.62□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 CLDN12-202ENST00000394604 846 ntTSL 58.45□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 AC006153.1-201ENST00000480135 371 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 CLDN12-207ENST00000462636 724 ntTSL 47.88□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 CLDN12-210ENST00000483862 338 ntTSL 25.17□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.146e-8■■■■□ 23.5
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TARDBPQ13148 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 23.5
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TARDBPQ13148 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 319.29■□□□□ 0.685e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.515e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.515e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.515e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-7■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 515.21■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 23.5
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TARDBPQ13148 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-211ENST00000505958 758 ntTSL 516.47■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-223ENST00000512671 795 ntTSL 215.78■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-213ENST00000506956 566 ntTSL 412.43□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 311.94□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-224ENST00000513182 537 ntTSL 48.36□□□□□ -1.073e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-222ENST00000512351 609 ntTSL 47.39□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-228ENST00000514730 569 ntTSL 56.4□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-225ENST00000514380 1519 ntTSL 26.23□□□□□ -1.413e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-218ENST00000510778 716 ntTSL 55.4□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-219ENST00000511401 577 ntTSL 54.74□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-227ENST00000514675 578 ntTSL 54.65□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-230ENST00000515023 388 ntTSL 54.24□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-229ENST00000514807 340 ntTSL 33.81□□□□□ -1.83e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.813e-6■■■■□ 23.5
TARDBPQ13148 RBPJ-215ENST00000507574 607 ntTSL 53.74□□□□□ -1.813e-6■■■■□ 23.5
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