Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 SAP1YER047C 2694 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SUL1YBR294W 2580 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 INA22YIR024C 651 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 CRS5YOR031W 210 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YOR218CYOR218C 420 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SRB8YCR081W 4284 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 TAE2YPL009C 3117 nt2.48□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 GEA1YJR031C 4227 nt2.47□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SLY1YDR189W 2001 nt2.47□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.47□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RPB10YOR210W 213 nt2.47□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 LRG1YDL240W 3054 nt2.47□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 HRD3YLR207W 2502 nt2.46□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 BNR1YIL159W 4128 nt2.46□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 snR46snR46 197 nt2.46□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 CAF120YNL278W 3183 nt2.45□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 CRM1YGR218W 3255 nt2.45□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 MNL2YLR057W 2550 nt2.45□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 ESL2YKR096W 3588 nt2.45□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 APC9YLR102C 798 nt2.45□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 SWA2YDR320C 2007 nt2.45□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 UTP14YML093W 2700 nt2.44□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 YBT1YLL048C 4986 nt2.44□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.44□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 AXL1YPR122W 3627 nt2.44□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 SCH9YHR205W 2475 nt2.44□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 PXA2YKL188C 2562 nt2.44□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 SSN2YDR443C 4263 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 POL3YDL102W 3294 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 SRO77YBL106C 3033 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 BCK1YJL095W 4437 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 MCM10YIL150C 1716 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 AFI1YOR129C 2682 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 RPS27BYHR021C 249 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 NOP10YHR072W-A 177 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 ELG1YOR144C 2376 nt2.43□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 NUM1YDR150W 8247 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 VPS16YPL045W 2397 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 MMS1YPR164W 4224 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 snR74snR74 88 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 RPL42BYHR141C 321 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 RPL42AYNL162W 321 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 SGF11YPL047W 300 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 ESC1YMR219W 4977 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 YOR296WYOR296W 3870 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 RRP6YOR001W 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 CUL3YGR003W 2235 nt2.41□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 YDR239CYDR239C 2364 nt2.41□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 RPH1YER169W 2391 nt2.41□□□□□ -2.02
TRM13Q12383 MSB2YGR014W 3921 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 ECM12YHR021W-A 456 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YNL114CYNL114C 372 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YEL043WYEL043W 2871 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SDC25YLL016W 3147 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 FLO11YIR019C 4104 nt2.4□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SIN3YOL004W 4611 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SNU13YEL026W 381 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YEL073CYEL073C 324 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 LCL1YPL056C 306 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 RFX1YLR176C 2436 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YPL216WYPL216W 3309 nt2.39□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 MMS22YLR320W 4365 nt2.38□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SWI5YDR146C 2130 nt2.38□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 HYP2YEL034W 474 nt2.38□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YBR178WYBR178W 375 nt2.38□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 ZRG8YER033C 3231 nt2.38□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.37□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.37□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.37□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 INP53YOR109W 3324 nt2.37□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 CLN3YAL040C 1743 nt2.37□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SWR1YDR334W 4545 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 DNF1YER166W 4716 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 EMP24YGL200C 612 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SNC1YAL030W 354 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 ACM1YPL267W 630 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YBR277CYBR277C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 MRD1YPR112C 2664 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YER138CYER138C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YER160CYER160C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YJR027WYJR027W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YML039WYML039W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YML045WYML045W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YMR050CYMR050C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
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