Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms