Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	UTP22	YGR090W	3714 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	GCN4	YEL009C	846 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	PRE4	YFR050C	801 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	VMR1	YHL035C	4779 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	UBR1	YGR184C	5853 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	CLN3	YAL040C	1743 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	YDR008C	YDR008C	351 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	BRP1	YGL007W	378 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	TAR1	YLR154W-C	375 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	YCL023C	YCL023C	348 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	SEC16	YPL085W	6588 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	IRR1	YIL026C	3453 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	OSH6	YKR003W	1347 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	VPS8	YAL002W	3825 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	GRR1	YJR090C	3456 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	YPR097W	YPR097W	3222 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	REV3	YPL167C	4515 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	RPL35A	YDL191W	363 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	TIM9	YEL020W-A	264 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	YKL183C-A	YKL183C-A	213 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NSE3	Q05541	TFC3	YAL001C	3483 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	VPS34	YLR240W	2628 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	HOP2	YGL033W	657 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YHL041W	YHL041W	450 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	RPL42B	YHR141C	321 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YNL114C	YNL114C	372 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	RPL42A	YNL162W	321 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YOR394C-A	YOR394C-A	168 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	EFR3	YMR212C	2349 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	SSD1	YDR293C	3753 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	RIM20	YOR275C	1986 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YCR043C	YCR043C	384 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	CSN9	YDR179C	489 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YFL063W	YFL063W	456 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	HTB2	YBL002W	396 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YCR102W-A	YCR102W-A	198 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	SAR1	YPL218W	573 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	TRL1	YJL087C	2484 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YAR029W	YAR029W	225 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	RPL38	YLR325C	237 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	SWI6	YLR182W	2412 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	CDC60	YPL160W	3273 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	SIR4	YDR227W	4077 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	EMP24	YGL200C	612 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	NUT2	YPR168W	474 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	RTT107	YHR154W	3213 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	RAV1	YJR033C	4074 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.65	□□□□□ -1.98
NSE3	Q05541	YDL062W	YDL062W	426 nt		2.65	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YGL149W	YGL149W	306 nt		2.65	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YJL052C-A	YJL052C-A	120 nt		2.65	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YLR053C	YLR053C	327 nt		2.65	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	RPH1	YER169W	2391 nt		2.65	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	GIP3	YPL137C	3831 nt		2.64	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YCR022C	YCR022C	345 nt		2.64	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	CYB5	YNL111C	363 nt		2.64	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	PXA2	YKL188C	2562 nt		2.64	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	COS111	YBR203W	2775 nt		2.64	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	GYP5	YPL249C	2685 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	RTT101	YJL047C	2529 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	LCL1	YPL056C	306 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	TFC8	YPL007C	1767 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	SWI5	YDR146C	2130 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	HDA3	YPR179C	1968 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YDR341C	YDR341C	1824 nt		2.63	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	NOP53	YPL146C	1368 nt		2.62	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	HTL1	YCR020W-B	237 nt		2.62	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	PEX4	YGR133W	552 nt		2.62	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	PCC1	YKR095W-A	267 nt		2.62	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	IRA2	YOL081W	9240 nt		2.62	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	IST2	YBR086C	2841 nt		2.61	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YOP1	YPR028W	543 nt		2.61	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.61	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	BNI1	YNL271C	5862 nt		2.61	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	UFD4	YKL010C	4452 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YDR048C	YDR048C	315 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	UPS1	YLR193C	528 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	KOG1	YHR186C	4674 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	MUK1	YPL070W	1839 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	PET309	YLR067C	2898 nt		2.6	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	SYH1	YPL105C	2550 nt		2.59	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	SLY1	YDR189W	2001 nt		2.59	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	YKR075W-A	YKR075W-A	270 nt		2.59	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	MF(ALPHA)1	YPL187W	498 nt		2.59	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	NAM7	YMR080C	2916 nt		2.59	□□□□□ -1.99
NSE3	Q05541	STH1	YIL126W	4080 nt		2.59	□□□□□ -2
NSE3	Q05541	BRE1	YDL074C	2103 nt		2.59	□□□□□ -2
NSE3	Q05541	SAP185	YJL098W	3177 nt		2.58	□□□□□ -2
NSE3	Q05541	CYC7	YEL039C	342 nt		2.58	□□□□□ -2
NSE3	Q05541	YOR282W	YOR282W	321 nt		2.58	□□□□□ -2
NSE3	Q05541	DNF1	YER166W	4716 nt		2.57	□□□□□ -2
NSE3	Q05541	YFR016C	YFR016C	3702 nt		2.57	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.8 ms