Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms